Stressigenomiikka

Elinympäristön aiheuttama stressi on yksi tärkeimmistä eliöiden esiintymiseen ja leviämiseen vaikuttavista tekijöistä erityisesti pohjoisilla alueilla, joilla lämpötilamuutokset ovat vaikeasti ennustettavia ja ääri-ilmiöt ovat lisääntyneet huomattavasti viime vuosina.

Stressigenomiikan työryhmässä tutkitaan erilaisten elinympäristöjen aiheuttaman stressin genomista taustaa. Selvitetämme erityisesti kandidaattigeenien ja niiden läheisyydessä esiintyvien transposonien eli nk. liikkuvien elementtien osuutta eliöiden stressinkestävyydessä.
Logo with fly and DNA

äܱٳٱ

ճٰܳ쾱ܲän tyyppi
ճٰܳ쾱ܲä
Tutkimuksen painoala
Luonnon perusilmiöt ja matemaattinen ajattelu
Tutkimusalueet
Evoluutiotutkimus
Tiedekunta
Matemaattis-luonnontieteellinen tiedekunta
Osasto
Bio- ja ympäristötieteiden laitos

ճٰܳ쾱ܲän kuvaus

Elinympäristön aiheuttama stressi on yksi tärkeimmistä eliöiden esiintymiseen ja leviämiseen vaikuttavista tekijöistä erityisesti pohjoisilla alueilla, joilla lämpötilamuutokset ovat vaikeasti ennustettavia ja ääri-ilmiöt ovat lisääntyneet huomattavasti viime vuosina.

Stressigenomiikan työryhmässä tutkitaan erilaisten elinympäristöjen aiheuttaman stressin genomista taustaa. Selvitetämme erityisesti kandidaattigeenien ja niiden läheisyydessä esiintyvien transposonien eli nk. liikkuvien elementtien osuutta eliöiden stressinkestävyydessä. Käytämme tutkimuksissamme mallilajina hyvin pohjoista ja erittäin kylmänkestävää Drosophila montana -mahlakärpästä ja yhdistelemme monenlaisia geneettisiä ja feno-tyyppisiä tutkimusmenetelmiä. Hyödynnämme erityisesti tutkimuslajillemme valmistettua koko genomin kattavaa transposoni-kirjastoa sekä olemassa olevaa tietoa stressinkestävyyteen liittyvistä kandidaattigeeneistä ja niiden toiminnasta.

Julkaisut

Julkaisu
2024
Saatavilla Open Access kautta

Genome Biology and Evolution
Poikela, Noora
Laetsch, Dominik R
Hoikkala, Ville
Lohse, Konrad
Kankare, Maaria
Julkaisu
2024
Saatavilla Open Access kautta

Molecular Ecology
Hoedjes, Katja M.
Grath, Sonja
Posnien, Nico
Ritchie, Michael G.
Schlötterer, Christian
Abbott, Jessica K.
Almudi, Isabel
Coronado‐Zamora, Marta
Durmaz, Mitchell Esra
Flatt, Thomas
Fricke, Claudia
Glaser‐Schmitt, Amanda
González, Josefa
Holman, Luke
Kankare, Maaria
Lenhart, Benedict
Orengo, Dorcas J.
Snook, Rhonda R.
Yılmaz, Vera M.
Yusuf Leeban
Julkaisu
2024
Saatavilla Open Access kautta

PLoS Biology
Kim, Bernard Y.
Gellert, Hannah R.
Church, Samuel H.
Suvorov, Anton
Anderson, Sean S.
Barmina, Olga
Beskid, Sofia G.
Comeault, Aaron A.
Crown, K. Nicole
Diamond, Sarah E.
Dorus, Steve
Fujichika, Takako
Hemker, James A.
Hrcek, Jan
Kankare, Maaria
Katoh, Toru
Magnacca, Karl N.
Martin, Ryan A.
Matsunaga, Teruyuki
Medeiros, Matthew J.
Miller, Danny E.
Pitnick, Scott
Schiffer, Michele
Simoni, Sara
Steenwinkel, Tessa E.
Syed, Zeeshan A.
Takahashi, Aya
Wei, Kevin H-C.
Yokoyama, Tsuya
Eisen, Michael B.
Kopp, Artyom
Matute, Daniel
Obbard, Darren J.
O’Grady, Patrick M.
Price, Donald K.
Toda, Masanori J.
Werner, Thomas
Petrov, Dmitri A.
Julkaisu
2024
Saatavilla Open Access kautta

Mobile DNA
Tahami, Mohadeseh S.
Vargas-Chavez, Carlos
Poikela, Noora
Coronado-Zamora, Marta
González, Josefa
Kankare, Maaria
Julkaisu
2024
Saatavilla Open Access kautta

BMC Microbiology
Valerio, Federica
Martel, Cornelia
Stefanescu, Constanti
van Nouhuys, Saskya
Kankare, Maaria
Duplouy, Anne
Julkaisu
2023
Saatavilla Open Access kautta

Molecular Ecology
Poikela, N.
Laetsch, D. R.
Kankare, M.
Hoikkala, A.
Lohse, K.

ճٰܳ쾱ܲä

ճٰܳ쾱ܲän vetäjät