Kun apurahansaaja työskentelee JYU:n tiloissa, tehdään hänen kanssaan (ns. apurahatutkijan sopimus). Laitoksen assistentti huolehtii sopimuksen tekemisestä.
Apurahansaaja ei ole työsuhteessa yliopistoon. Mahdollinen tuntiopetuksesta suoritettava korvaus maksetaan palkkiona. Tohtorikoulutettavan tehtävä on väitöskirjatyö; jos tehtävään sisältyy muita vastuita ja velvoitteita, palkataan henkilö työsuhteeseen muulla nimikkeellä.
Apurahansaajan sosiaaliturva. Apurahansaajan on itse selvitettävä eläkevakuutuksensa Melalta ja tehtävä apurahansaajan vakuutushakemus. Lisätietoa apurahansaajan sosiaaliturvasta löytyy Melan sivuilta, tai puhelimitse 029 435 2650.
Apurahansaajan verotus. Apurahansaajan on itse selvitettävä verotukseen liittyvät asiat ja ilmoitettava saamansa apurahat veroilmoituksessaan.
Apurahatutkijoiden tulee kirjata tutkimus- ja julkaisutietonsa yliopiston tutkimusrekisteriin, .
Apurahatutkijan itsenäisen työn tuloksena saamat immateriaalioikeudet kuuluvat tutkijalle itselleen, ellei niistä erikseen toisin sovita.
Tohtoriopiskelijan tulee varmistaa, että ohjausasiakirja on voimassa. tarkoitus on selkeyttää tohtoriopiskelijan ja ohjaajien vastuita sekä edistää tohtoriopintojen suorittamista.
On tärkeätä, etttä tutustut myös .