BENA2008 Bioinformatiikka (3 op)

Arvosteluasteikko
0-5
Opetuskieli/-kielet
suomi , englanti
³Õ²¹²õ³Ù³Ü³Ü³ó±ð²Ô°ì¾±±ôö(³Ù)
Pekka Postila

Osaamistavoitteet

Opiskelija hallitsee bioinformatiikan perusmenetelmät ja osaa hakea ja tulkita eri aineistoja DNA-, RNA-, ja proteiinitasolla ja ymmärtää biologisen informaation kulun geeneistä proteiinien atomitason vuorovaikutuksiin. Opiskelija oppii kuinka kirjoitetaan hyvä, tieteellinen työselostus. Lisäksi opiskelija osaa kurssin jälkeen ratkaista bioinformatiikkamenetelmien avulla tutkimusongelmia itsenäisesti ja pienryhmässä.

Suoritustavat

4 harjoituskertaa: sis. luentoja (2t/kerta) + 4 harjoitustuntia sekä projektityöosuuden (+ itsenäinen työskentely)
raportti
tentti

³§¾±²õä±ô³Ùö

-DNA-, RNA ja proteiinitietokantojen käyttö
-BLAST-haut ja tulostentulkinta
-DNA- ja proteiinisekvenssien linjaus; DNA/protein sequence alignment
-Proteiinirakenteiden visualisointi ja sekvenssierojen vaikutusten arviointi
-Projektityö ja sen tieteellinen raportointi
-Tulosten kriittinen arviointi

Arviointiperusteet

pakollinen läsnäolo
raportti
tentti